（一）主觀因素沒有發表論文時的檢查，一般由該文章的編輯進行，以一定的學科背景進行編輯，在整個過程中跟蹤這篇文章。可以發現和調整學術不正當檢查系統的檢查結果不同的問題。發表了論文，一般是第三者的檢查。因為論文的范圍很廣，檢查者和檢查報告書的使用者不可能有全面的學術背景。檢查人員根據計算機的檢查結果發布檢查報告，使用者閱讀檢查報告的數據，判定測定者是否具有入門資格。
只不過是根據檢查報告的數據，也沒有一些作者文章的不恰當、文章的正確引用等，由于以上的原因，有些檢查結果和真實的抄襲率有一定的差距，很難表現出完全的公正性。根據對學術上的不正當檢查系統的研究，提出了正確識別“文字復制比”和“文章剽竊率”的提案。我們通常在檢查報告中看到的“文字復制比”是系統提供的疑似剽竊的文字，學術論文的調查重量是“文章的剽竊率”定性復制文章的比例。
[4]在實際操作中，正確分析“文字復制比”的真偽，即使不知道文章的學術內容，也可以根據幾個共同規則來識別抄襲的程度。（二）客觀因素Cnki期刊文獻檢查系統以“中國學術期刊網絡出版總庫”為全文數據庫，目前支持的原稿種類為DOC、TXT、CAJ、KDH、NH、PDF5種格式，從單詞、句子、段落等多方面進行學術研究的不正當行為。[5]檢測系統的功能表明該系統可以檢測多個文獻，但實際上不同種類的電子文檔在多個檢測中會出現檢測值完全不同的現象。
名研究人員在中國的期刊網站上檢索了與同一作者不同的兩篇文章，在AMLC上下載并調查了這兩篇文章的caj版本，發現兩篇文章和自己的比較結果也不是100%。另一種情況是，同一篇文章用不同的形式進行調查，得出了20分的差距。
[6]不同的文件格式可能對測量結果有很大影響。這是因為系統以word文件為基準，在其他種類的文件以“外形比例”識別的期間，可能會有一些技術問題。