與氣相色譜不同的是液相色譜中流動相亦參與組分的分離過程，其組成、比例和pH值可靈活調節，分離模式多樣。 在實際操作中主要通過改變流動相的組成來調節樣品在色譜柱的保留值和選擇性，從而使不同樣品得到分離。

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